消化器内科では、大腸内視鏡によるポリープ切除術（ポリペクトミー・EMR、必要時にはダブルバルーン内視鏡を使用）による入院が最も多くなっています。また、通常のポリープ切除術では困難な早期癌などを内視鏡的に切除する早期悪性腫瘍粘膜下層剥離術（ESD）も積極的に実施しており、特に大腸ESDの症例数が多いのが当院の特徴となります。
また、総胆管結石や胆管炎、胆管癌などに対するERCP（内視鏡逆行性胆管膵管造影）による内視鏡手術症例（内視鏡的胆道結石除去術、胆道ステント留置術など）も積極的に受け入れているほか、急性腸炎、がん化学療法など、消化器疾患全般の診療に対応しています。

外科では、消化器内科と連携して大腸、直腸、胃の悪性腫瘍及び膵胆管の手術を実施しており、術後の病理組織診断等の結果により、術後がん化学療法を実施しています。
そのため、がん化学療法の患者数は、繰り返し再入院を要する場合があるため、手術患者数よりも件数自体は多くなっています。
また、鼡径ヘルニアなどのヘルニア根治手術や、痔核などの肛門根治手術の件数も多くなっています。

消化器病センターでは、内視鏡による各種検査・手術を実施しています。内視鏡手術の件数は、大腸内視鏡によるポリープ切除術（ポリペクトミー・EMR、必要時にはダブルバルーン内視鏡を使用）が最も多く、次いで「早期悪性腫瘍大腸粘膜下層剥離術(ESD)」となっています。
また、胆道疾患等には、ERCP(内視鏡的逆行性胆管膵管造影）を実施し、合わせて胆管ステント留置術や乳頭切開術、排石術などを実施する症例が多くなっています。

手術室では、腹腔鏡を用いた手術が多く、胆嚢摘出術、鼡径ヘルニア手術、結腸悪性腫瘍切除術及び虫垂切除術の順となっています。
また、注射（点滴）による、がん化学療法を安全に実施するために必要な埋込型カテーテル(CVポート)を設置する件数も多くなっています。